A emergência do conceito de território educativo, no início da década de noventa, introduz, no sistema educativo nacional, uma nova dinâmica organizacional dos estabelecimentos de ensino públicos. Ganha especial dinâmica a associação de estabelecimentos de ensino em torno de um Projeto Educativo comum (regime de autonomia, administração e gestão, instituído pelo Decreto-Lei nº 43/89, de 3 de fevereiro).

Desde 1995, assistimos a formas de trabalho colaborativo entre as EB1 da Lameira e a EB2,3 de Gualtar que, em parceria com outras instituições, se associaram no desenvolvimento de projetos comuns. No entanto, é o “Pacto Instituinte”,  aprovado a 14 de maio de 1997, pelo Conselho Pedagógico da EB 2,3 de Gualtar, e subscrito voluntariamente, a 30 de maio do mesmo ano, pelos JI de Bouça e Areias de Baixo e pelas EB1 de Lameira, Igreja, Bela Vista e Pidre, que funda e institui a Associação de Escolas da Nascente do Este (AENE).

A partir do ano letivo de 2000/01, integram a Associação de Escolas da Nascente do Este todas as unidades educativas do ensino público pré-escolar e dos 1º, 2º e 3º ciclos, dependentes do Ministério da Educação, situadas nas freguesias de Gualtar, Este S. Pedro, Este S. Mamede, Crespos, Pousada, Navarra e Santa Lucrécia que, a 7 de julho de 2000, veem nascer o seu Projeto Educativo.

O ano letivo de 2003/04 é marcado por uma nova realidade que determina o fim da Associação de Escolas da Nascente do Este e o início do Agrupamento Vertical de Escolas da Nascente do Este, assumindo a sigla AVENE. Por despacho ministerial, a partir de 1 de setembro de 2003, é redefinido um ordenamento do território educativo do agrupamento, passando a integrar o AVENE todos os estabelecimentos de ensino da rede pública do Ministério da Educação, localizados nas freguesias de Gualtar (JI de Bouça, EB1 Braga nº 27 – Lameira e EB 2,3 de Gualtar – escola sede do AENE), Este S. Pedro (JI Areias de Baixo e EB1 de Braga nº 30), Este S. Mamede (JI de Pidre e EB1 de Pidre), Espinho (EB1/JI do Salgueiral), Pedralva (JI de Gulmeira e EB1 de Codeçosa) e Sobreposta (JI da Igreja, EB1 de Outeiro e EBM nº 888 – extinta no final de ano letivo de 2003/04). A 25 de maio de 2005, é aprovado o Projeto Educativo “Educar na Excelência” que marcou, com as devidas atualizações, o ideário do agrupamento até à agregação no Agrupamento de Escolas Carlos Amarante.

Por decisão dos órgãos de direção, gestão e administração, em dezembro de 2011, o AVENE passou a designar-se Agrupamento de Escolas de Gualtar (AEG).